[发明专利]用于检测IGH重排的方法、计算设备和计算机存储介质有效
申请号: | 202010629700.2 | 申请日: | 2020-07-03 |
公开(公告)号: | CN111524548B | 公开(公告)日: | 2020-10-23 |
发明(设计)人: | 姚继成;石教春;张姣玲;王维锋 | 申请(专利权)人: | 至本医疗科技(上海)有限公司 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00;G16B30/20;G16B40/00 |
代理公司: | 北京市金杜律师事务所 11256 | 代理人: | 王茂华 |
地址: | 201203 上海市浦东新*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本公开涉及一种检测IGH重排的方法、计算设备和计算机存储介质。该方法包括:获取关于待测样本的转录组测序序列与参考基因组测序序列的比对结果信息;获取一端比对到IGH基因并且另一端比对到其它基因的多个reads信息,以便获取经组装后的序列片段;对经组装后的序列片段进行过滤;将经过滤的序列片段与IGH基因和相关基因转录本进行比对,以便基于比对结果来保留阳性重排结果序列;以及将所获取的用于组装序列片段的对应reads序列与所保留的所述阳性重排结果序列进行比对,以便确定用于计算发生IGH重排的频率的支持reads数量。本公开能够有效提高检测IGH重排的效率和准确性。 | ||
搜索关键词: | 用于 检测 igh 重排 方法 计算 设备 计算机 存储 介质 | ||
【主权项】:
暂无信息
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