[发明专利]一种利用简化基因组测序数据鉴定蚕豆SNP的方法在审
| 申请号： | 202011310367.5 | 申请日： | 2020-11-20 |
| 公开（公告）号： | CN112553361A | 公开（公告）日： | 2021-03-26 |
| 发明（设计）人： | 吴新义;李汉美;刘庭付;吴晓花;汪颖;汪宝根;鲁忠富;李国景 | 申请（专利权）人： | 浙江省农业科学院 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6869;G16B30/00;G16B20/20 |
| 代理公司： | 北京哌智科创知识产权代理事务所(普通合伙) 11745 | 代理人： | 宗兵 |
| 地址： | 310000 *** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种利用简化基因组测序数据鉴定蚕豆SNP的方法，包括：步骤一、提取样品基因组DNA；步骤二、构建RAD文库，基因组DNA使用EcoRI酶切，利用PCR扩增法富集文库，采用琼脂糖凝胶回收目的条带，单末端进行测序；步骤三、生成原始序列并进行序列质控分析，根据序列相似性将高质量序列聚类生成RAD‑tags，将RAD‑tags聚类分群进行SNP calling，矫正SNP基因型；步骤四、KASP标记开发与SNP基因分型。本发明方法利用基因组测序数据挖掘SNP，不仅可以鉴定出基因表达区域的SNP突变，还可以鉴定出基因内部和基因间等非编码区域的SNP突变，SNP来源更丰富。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 利用 简化 基因组 序数 鉴定 蚕豆 snp 方法 | ||
【主权项】：
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