[发明专利]基于高通量测序寄生虱线粒体基因组组装的方法和应用在审
| 申请号： | 202110171393.2 | 申请日： | 2021-02-04 |
| 公开（公告）号： | CN114395630A | 公开（公告）日： | 2022-04-26 |
| 发明（设计）人： | 刘国华;聂瑜;符意甜;张瑜;邓园萍 | 申请（专利权）人： | 湖南农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 长沙和雅知识产权代理事务所(普通合伙) 43238 | 代理人： | 林传贵 |
| 地址： | 410011 *** | 国省代码： | 湖南;43 |
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| 摘要： | 本发明为基于高通量测序寄生虱线粒体基因组组装的方法和应用，属于生物信息学技术领域，使用两对引物对寄生虱的全基因组DNA进行扩增和测序，得cox1和rrnS基因部分保守序列；再对全基因组DNA测定浓度后构建成对末端基因组DNA文库，高通量测序，处理后产生了2GB数据；根据cox1和rrnS基因部分保守序列对2GB数据进行重新组装重叠群，直至重叠群的两端重叠后进行多重序列比对，鉴定出保守的非编码区序列并将其作为比对Illumina序列数据集的参考，直至寄生虱线粒体组被全部组装。本方案操作简便，成本低速度快，准确性高，组装后的线粒体基因组通过BLAST进行校准，长片段PCR法进行验证，解决了寄生虱线粒体基因组的组装与注释的难题。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 通量 寄生 线粒体 基因组 组装 方法 应用 | ||
【主权项】：
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