[发明专利]一种SNP杂合样本的半定量方法在审
申请号: | 202110205947.6 | 申请日: | 2021-02-24 |
公开(公告)号: | CN112899355A | 公开(公告)日: | 2021-06-04 |
发明(设计)人: | 万谦;蒋小辉;向俊蓓 | 申请(专利权)人: | 成都新生命霍普医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 成都行之专利代理事务所(普通合伙) 51220 | 代理人: | 史丽红 |
地址: | 610000 四川省成*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | 本发明公开了一种SNP杂合样本的半定量方法,包括如下步骤:1)合成两个长度相同的DNA模板P‑ctDNA‑1和P‑ctDNA‑2,两者序列仅在中部的同一位点存在SNP差异;2)合成能通过PCR完全扩增P‑ctDNA‑1和P‑ctDNA‑2的引物P‑ctDNA‑3和引物P‑ctDNA‑4;3)按多种不同的比例混合P‑ctDNA‑1和P‑ctDNA‑2,得到P‑ctDNA‑2占比不同的DNA混合物;4)以步骤3)中混合物作为模板,以P‑ctDNA‑3和P‑ctDNA‑4为引物进行PCR扩增,然后回收条带,再以P‑ctDNA‑3为引物进行Sanger一代DNA测序,获得不同比例下SNP位点的测序图谱。本发明通过人为合成两种具有SNP差异的DNA模板,然后采用不同比例混合两种DNA模板来模拟具有多态性的SNP杂合样本,从而建立不同比例下SNP位点的重叠状态图谱,这样仅仅依靠Sanger一代DNA测序得到SNP杂合样本的图谱即可初步判断样本的SNP杂合程度。 | ||
搜索关键词: | 一种 snp 样本 定量 方法 | ||
【主权项】:
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