[发明专利]基于特征序列设计引物的方法及系统在审
申请号: | 202110754999.9 | 申请日: | 2021-07-01 |
公开(公告)号: | CN113403368A | 公开(公告)日: | 2021-09-17 |
发明(设计)人: | 易康;安泰然 | 申请(专利权)人: | 南京诺因生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6811 | 分类号: | C12Q1/6811 |
代理公司: | 南京禾易知识产权代理有限公司 32320 | 代理人: | 张松云 |
地址: | 211800 江苏省南京市江北新区新锦湖路*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于特征序列设计引物的方法,其步骤包括:将阳性序列和阴性序列进行整合;将阳性序列分割成适合进行比对的片段,并记录分割的位置;使用blast对阴性序列进行建库,然后将片段化的阳性序列比对到阴性序列进行筛选,得到一致性较低的特异性序列;使用primer3对特异性序列进行引物设计,得到上游引物、下游引物和探针的序列及位置;使用blast比对软件、阴性序列数据库、NCBI的nt数据库对得到的引物和探针进行再次筛选,并取引物和探针的交集;通过目录输出比对结果。并公开了基于特征序列设计引物的系统。本发明可以一步完成从基因组到目标序列和引物片段的引物设计。 | ||
搜索关键词: | 基于 特征 序列 设计 引物 方法 系统 | ||
【主权项】:
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