[发明专利]基于特征序列设计引物的方法及系统在审

专利信息
申请号: 202110754999.9 申请日: 2021-07-01
公开(公告)号: CN113403368A 公开(公告)日: 2021-09-17
发明(设计)人: 易康;安泰然 申请(专利权)人: 南京诺因生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6811 分类号: C12Q1/6811
代理公司: 南京禾易知识产权代理有限公司 32320 代理人: 张松云
地址: 211800 江苏省南京市江北新区新锦湖路*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种基于特征序列设计引物的方法,其步骤包括:将阳性序列和阴性序列进行整合;将阳性序列分割成适合进行比对的片段,并记录分割的位置;使用blast对阴性序列进行建库,然后将片段化的阳性序列比对到阴性序列进行筛选,得到一致性较低的特异性序列;使用primer3对特异性序列进行引物设计,得到上游引物、下游引物和探针的序列及位置;使用blast比对软件、阴性序列数据库、NCBI的nt数据库对得到的引物和探针进行再次筛选,并取引物和探针的交集;通过目录输出比对结果。并公开了基于特征序列设计引物的系统。本发明可以一步完成从基因组到目标序列和引物片段的引物设计。
搜索关键词: 基于 特征 序列 设计 引物 方法 系统
【主权项】:
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