[发明专利]一种高精度及高覆盖度的谱系树追踪方法在审
申请号: | 202310540707.0 | 申请日: | 2023-05-12 |
公开(公告)号: | CN116356003A | 公开(公告)日: | 2023-06-30 |
发明(设计)人: | 杨建荣;陈小舒;陈锋;李梓樟;张晓玉;吴鹏;杨文静 | 申请(专利权)人: | 中山大学 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 刘克豹 |
地址: | 510220 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种高精度及高覆盖度的谱系树追踪方法,本发明涉及细胞谱系追踪技术领域,具体包括以下步骤:选取序列完全不同的单向RNA1、单向RNA2、单向RNA3和单向RNA4备用,选取单细胞克隆扩增制备具有13个编辑位点的谱系条形码备用;采用细胞谱系条形码技术对单向RNA1、单向RNA2、单向RNA3和单向RNA4分别与谱系条形码的13个编辑位点匹配。该高精度及高覆盖度的谱系树追踪方法,增加谱系条形码在所有细胞中的平均表达量,降低了编辑位点被消耗的速度,增加了可追踪时间,同时降低了跨位点缺失突变的比例,获得的细胞谱系树单个叶子的比例高,实现了分辨率为单个细胞级别的谱系树测定方法,降低克隆扩增中细胞的死亡率,以及细胞消化中的损失率。 | ||
搜索关键词: | 一种 高精度 覆盖 谱系 追踪 方法 | ||
【主权项】:
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